جاء في تقرير نشرته وزارة الاقتصاد والمالية، أن المكتب الوطني للسكك الحديدية يواجه إشكالات متعلقة بالمديونية، إذ بلغت 34.981 مليون درهم في 2017، لترتفع في النصف الأول من 2018 إلى 38.2 مليون درهم، في وقت كانت فيه المديونية في 2016 بقيمة 26.473 مليون درهم.
ويفوق عجز خزينة المكتب مليوني درهم في 2017، إذ تم اعتماد إجراءات لتقليصه بهدف ضمان أداء الموردين وتغطية التزامات مكتب القطارات، وذكر التقرير الوزاري أنه تم اختتام أنشطة النقل السككي ونقل السلع لسنة 2017، برقم معاملات قدره 3.697 مليون درهم، بتحسن طفيف مقارنة مع سنة 2016، ببلوغ نسبة التحسن 0.4 في المائة.